برداشت در سه مرحله انجام می گیرد که به هر برداشت یک فلش می گویند هر فلش بین ۴ تا ۶ روز طول می کشد که در این مدت هر روز برداشت قارچ خواهیم داشت ، بعد از آن دو روز طول می کشد تا قارچ های فلش بعدی ظاهر شوند . دقت داشته باشید در هیچ یک از مراحل پرورش قارچ به نور نیازی نیست خصوصاً در این مرحله سالن باید کاملاً تاریک باشد . در پایان کمپوست فاز ۲ ، اگر مراحل کار به طور صحیح انجام شده باشد ، هیچگونه بوی آمونیاک به مشام نمی رسد و کمپوست پوشیده از کلنی سفید رنگ قارچ های ذره بینی مفیدی بنام اکتینومیست- fang fire می شود . در پایان این مرحله مقدار آمونیاک به کمتر از ۱ / ۰ قسمت در میلیون و مقدار نیتروژن به ۲ تا ۵ / ۲ درصد می رسد . در این زمان حدود ۷۰ درصد سطح کمپوست باید سفید شده باشد و قطره های آب تشکیل شده در زیر نایلون کمپوست به رنگ طلایی درآمده باشند . در این موقع درجه حرارت بستر باید بین ۱۰ تا ۱۴ درجه سانتی گراد باشد ولی هر اندازه قارچ ها رشد بیشتری پیدا نمایند می توان درجه حرارت را از ۱۴ به ۱۶/۵درجه سانتی گراد رساندو میزان تهویه را نیز بالا برد ولی باید دقت کرد که جهت حرکت هوا، به طرف سطح قارچ نباشد.رطوبت هوا و آبیاری: آب و رطوبت عامل مهمی در پرورش قارچ است.
ضمن اینکه به واسطه سهولت پرورش قارچ های خوراکی می توان آنها را به صورت تازه ، خشک ، کنسرو و پودر به بازار عرضه نمود . می توان گفت این مرحله مهم ترین بخش کار می باشد، چون از زمان برداشت شما مدت کمی برای عرضه به بازار خواهید داشت. برای اینکه کشت قارچ ها در خانه برای شما آسان تر شود می توانید از کیت های آماده موجود در بازار استفاده کنید . استفاده از قفسه ها میتواند سطح زیر کشت را افزایش دهد و از فضای موجود حداکثر استفاده را برد. این فرمولها متنوع می باشند و تاکنون فرمول خاصی به عنوان یک فرمول کلی و جهانی در سراسر جهان ارائه نگردیده است و در هر منطقه ای که کشت و پرورش قارچ دکمه ای صورت می پذیرد بر حسب مواد اولیه موجود ، ممکن است از یک یا چند فرمول منطبق با شرایط آن منطقه استفاده شود . مرحله چهارم: ظرف را در یک مکان تاریک و سرد با دمای ۱۴ درجه سانتی گراد بگذارید. ظرف کنسرو در اتوکلاو به مدت ۶۰ دقیقه در دمای ۱۲۱-۱۳۰ درجه سانتی گراد استریل شده و در آخر با آب سرد، قوطی ها را خنک میکنند تا درجه حرارت کاهش یافته و فشار آن به صفر افت کند.
هنگامی که کیسه خنک شوند ، آن ها را به یک اتاق تاریک با دمایی بین ۲۸ تا ۳۵ درجه سانتی گراد که دارای دی اکسید کربن زیادی باشد انتقال می دهند . عرض قفسه ها در حالت دو طرفه نهایت تا ۱۴۰ سانتیمتر است و در حالت یک طرفه ( کنار دیوارها ) حداکثر تا ۷۰ سانتیمتر می باشد . چنانچه اسپان ، تازه باشد بذور به راحتی از هم جدا می شوند و چنانچه بخواهیم اسپان تازه را نگهداری کنیم و برای دور بعد از آن استفاده کنیم ، بهتر است که اسپان ها را در یخچال با دمای ۳ درجه سانتی گراد نگهداری کنیم . بهترین موقع برای پرورش قارچ دکمه ای در خانه بین ماههای مهر تا آذر است ولی چنانچه امکانات تهویه هوا و متعادل نمودن درجه حرارت محیط محل پرورش وجود داشته باشد میتوان پرورش قارچ دکمه ای را در ماههای دیگر سال تعمیم داد. ۳ هستند که معمولا برای تنظیم دمایی از آنها استفاده میشود. به طور کلی قارچه دکمه ای غیر وحشی در ابتدا کاملا سفید است ( قارچ سفید ) ، کمی که بالغ شود قهوه ای می شود ( قارچ قهوه ای ) ، همچنین در صورت بالغ شدن بیش تر قهوه ای تر و بزرگ تر می شود ( قارچ پورتوبلو ) . .
را در آب می جوشانیم تا کاملا استریل شوند . پس از انجام عمل سمپاشی، در و پنجرههای سالنها به مدت دو تا سه روز کاملا بسته می ماند و سپس تهویه در طول دو و سه روز انجام میگیرد. دما در این مرحله ۲۵ الی ۱۸ سانتیگراد می باشد این مرحله ۱۲ الی ۱۵ روز طول می کشد . این روش به علت غیر شیمیایی بودن و قدرت نفوذ بالای بخار آب ، ارجحیت دارد . اختلاط صحیح و یکنواخت بذر قارچ با کمپوست مهم بوده و بهترین روش اختلاط ، توزیع یکنواخت ۵/۴ ( چهار پنجم ) اسپان مورد نیاز در درون کمپوست و پوشانیدن سطح کمپوست با ۴/۱ ( یک چهارم ) باقیمانده مفید است . روش های کشت متفاوتی وجود دارد از جمله قفسه ای ( بلوکی و کیسه ای ) ، جعبه ای ، گلدانی و بستری که رایج ترین آنها دو روش سیستم کشت قفسه ای و جعبه ای می باشند .